Protein–RNA interactions for Protein: P08579

SNRPB2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPB2P08579 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPB2P08579 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPB2P08579 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms