Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRPRAP08240 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms