Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYCNP04198 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MYCNP04198 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MYCNP04198 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MYCNP04198 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYCNP04198 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYCNP04198 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYCNP04198 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYCNP04198 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYCNP04198 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYCNP04198 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MYCNP04198 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYCNP04198 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYCNP04198 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYCNP04198 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYCNP04198 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYCNP04198 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYCNP04198 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYCNP04198 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYCNP04198 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYCNP04198 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYCNP04198 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYCNP04198 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYCNP04198 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYCNP04198 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYCNP04198 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYCNP04198 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYCNP04198 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYCNP04198 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MYCNP04198 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYCNP04198 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MYCNP04198 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYCNP04198 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYCNP04198 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYCNP04198 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYCNP04198 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYCNP04198 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYCNP04198 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYCNP04198 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYCNP04198 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYCNP04198 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYCNP04198 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYCNP04198 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYCNP04198 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYCNP04198 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYCNP04198 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYCNP04198 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYCNP04198 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYCNP04198 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYCNP04198 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYCNP04198 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYCNP04198 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYCNP04198 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYCNP04198 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYCNP04198 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYCNP04198 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYCNP04198 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYCNP04198 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MYCNP04198 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYCNP04198 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYCNP04198 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYCNP04198 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYCNP04198 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYCNP04198 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYCNP04198 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYCNP04198 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYCNP04198 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYCNP04198 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYCNP04198 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYCNP04198 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYCNP04198 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYCNP04198 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYCNP04198 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYCNP04198 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYCNP04198 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYCNP04198 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYCNP04198 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYCNP04198 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYCNP04198 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYCNP04198 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYCNP04198 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYCNP04198 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYCNP04198 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYCNP04198 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYCNP04198 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYCNP04198 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYCNP04198 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYCNP04198 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYCNP04198 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYCNP04198 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYCNP04198 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYCNP04198 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYCNP04198 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYCNP04198 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYCNP04198 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MYCNP04198 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYCNP04198 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYCNP04198 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYCNP04198 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYCNP04198 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms