Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPAN13O95857 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 240.2 ms