Protein–RNA interactions for Protein: O95718

ESRRB, Steroid hormone receptor ERR2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRBO95718 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ESRRBO95718 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ESRRBO95718 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ESRRBO95718 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESRRBO95718 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ESRRBO95718 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms