Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAMBPO95630 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
STAMBPO95630 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms