Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEC24BO95487 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEC24BO95487 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms