Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE4BO95155 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE4BO95155 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms