Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOBTB3O94955 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOBTB3O94955 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms