Protein–RNA interactions for Protein: O75192

PEX11A, Peroxisomal membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11AO75192 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX11AO75192 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms