Protein–RNA interactions for Protein: O75146

HIP1R, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1RO75146 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIP1RO75146 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIP1RO75146 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIP1RO75146 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIP1RO75146 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HIP1RO75146 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIP1RO75146 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HIP1RO75146 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms