Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG13O75143 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG13O75143 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG13O75143 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG13O75143 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG13O75143 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG13O75143 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG13O75143 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG13O75143 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG13O75143 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG13O75143 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG13O75143 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG13O75143 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG13O75143 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG13O75143 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG13O75143 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG13O75143 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG13O75143 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG13O75143 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG13O75143 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG13O75143 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG13O75143 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG13O75143 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG13O75143 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG13O75143 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG13O75143 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG13O75143 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG13O75143 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG13O75143 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG13O75143 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG13O75143 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG13O75143 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG13O75143 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG13O75143 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG13O75143 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG13O75143 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG13O75143 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG13O75143 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG13O75143 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG13O75143 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG13O75143 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG13O75143 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG13O75143 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG13O75143 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG13O75143 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG13O75143 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG13O75143 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG13O75143 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG13O75143 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG13O75143 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG13O75143 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG13O75143 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG13O75143 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG13O75143 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG13O75143 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG13O75143 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG13O75143 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG13O75143 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG13O75143 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG13O75143 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG13O75143 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG13O75143 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG13O75143 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG13O75143 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG13O75143 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG13O75143 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG13O75143 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG13O75143 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG13O75143 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG13O75143 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG13O75143 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG13O75143 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG13O75143 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG13O75143 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG13O75143 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG13O75143 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG13O75143 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG13O75143 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG13O75143 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG13O75143 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG13O75143 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG13O75143 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG13O75143 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG13O75143 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG13O75143 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG13O75143 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG13O75143 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG13O75143 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG13O75143 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG13O75143 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG13O75143 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG13O75143 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG13O75143 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG13O75143 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG13O75143 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG13O75143 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG13O75143 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG13O75143 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATG13O75143 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG13O75143 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms