Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUBNO60494 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUBNO60494 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CUBNO60494 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUBNO60494 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CUBNO60494 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUBNO60494 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUBNO60494 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUBNO60494 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUBNO60494 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUBNO60494 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUBNO60494 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUBNO60494 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUBNO60494 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUBNO60494 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUBNO60494 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUBNO60494 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUBNO60494 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUBNO60494 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUBNO60494 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CUBNO60494 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUBNO60494 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUBNO60494 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUBNO60494 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CUBNO60494 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUBNO60494 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUBNO60494 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUBNO60494 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUBNO60494 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUBNO60494 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUBNO60494 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUBNO60494 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUBNO60494 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUBNO60494 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUBNO60494 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUBNO60494 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUBNO60494 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUBNO60494 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUBNO60494 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUBNO60494 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUBNO60494 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUBNO60494 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUBNO60494 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CUBNO60494 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUBNO60494 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUBNO60494 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUBNO60494 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUBNO60494 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUBNO60494 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUBNO60494 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUBNO60494 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUBNO60494 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUBNO60494 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUBNO60494 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUBNO60494 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUBNO60494 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUBNO60494 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUBNO60494 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUBNO60494 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUBNO60494 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUBNO60494 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUBNO60494 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUBNO60494 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUBNO60494 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUBNO60494 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUBNO60494 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CUBNO60494 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUBNO60494 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUBNO60494 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUBNO60494 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUBNO60494 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUBNO60494 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUBNO60494 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUBNO60494 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUBNO60494 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUBNO60494 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUBNO60494 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUBNO60494 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUBNO60494 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CUBNO60494 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUBNO60494 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUBNO60494 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUBNO60494 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUBNO60494 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUBNO60494 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUBNO60494 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUBNO60494 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUBNO60494 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUBNO60494 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUBNO60494 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUBNO60494 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUBNO60494 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUBNO60494 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUBNO60494 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUBNO60494 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUBNO60494 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CUBNO60494 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CUBNO60494 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUBNO60494 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUBNO60494 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms