Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALUO43852 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALUO43852 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALUO43852 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALUO43852 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALUO43852 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALUO43852 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALUO43852 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALUO43852 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALUO43852 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALUO43852 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALUO43852 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALUO43852 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALUO43852 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALUO43852 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALUO43852 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALUO43852 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CALUO43852 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALUO43852 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALUO43852 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALUO43852 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CALUO43852 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALUO43852 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALUO43852 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALUO43852 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALUO43852 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALUO43852 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALUO43852 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALUO43852 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALUO43852 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALUO43852 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CALUO43852 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CALUO43852 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALUO43852 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALUO43852 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALUO43852 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALUO43852 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALUO43852 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALUO43852 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALUO43852 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALUO43852 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALUO43852 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALUO43852 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALUO43852 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALUO43852 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALUO43852 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALUO43852 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALUO43852 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CALUO43852 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALUO43852 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALUO43852 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALUO43852 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALUO43852 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALUO43852 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALUO43852 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALUO43852 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALUO43852 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALUO43852 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALUO43852 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALUO43852 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALUO43852 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALUO43852 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALUO43852 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALUO43852 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALUO43852 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALUO43852 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALUO43852 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALUO43852 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALUO43852 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALUO43852 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALUO43852 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALUO43852 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALUO43852 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALUO43852 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALUO43852 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALUO43852 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALUO43852 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALUO43852 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALUO43852 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALUO43852 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALUO43852 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALUO43852 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALUO43852 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALUO43852 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CALUO43852 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALUO43852 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALUO43852 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALUO43852 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALUO43852 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALUO43852 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALUO43852 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALUO43852 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALUO43852 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALUO43852 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALUO43852 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALUO43852 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALUO43852 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALUO43852 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALUO43852 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CALUO43852 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms