Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYTH3O43739 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYTH3O43739 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYTH3O43739 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYTH3O43739 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYTH3O43739 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYTH3O43739 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYTH3O43739 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYTH3O43739 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYTH3O43739 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYTH3O43739 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYTH3O43739 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYTH3O43739 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYTH3O43739 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CYTH3O43739 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CYTH3O43739 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYTH3O43739 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms