Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAD51CO43502 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms