Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTRA2O43464 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms