Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF3O43395 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms