Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NDUFS4O43181 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFS4O43181 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms