Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SGSM2O43147 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SGSM2O43147 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SGSM2O43147 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SGSM2O43147 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SGSM2O43147 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SGSM2O43147 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SGSM2O43147 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SGSM2O43147 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SGSM2O43147 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SGSM2O43147 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SGSM2O43147 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SGSM2O43147 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SGSM2O43147 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SGSM2O43147 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SGSM2O43147 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SGSM2O43147 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SGSM2O43147 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SGSM2O43147 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SGSM2O43147 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SGSM2O43147 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SGSM2O43147 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SGSM2O43147 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SGSM2O43147 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SGSM2O43147 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SGSM2O43147 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SGSM2O43147 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SGSM2O43147 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SGSM2O43147 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SGSM2O43147 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SGSM2O43147 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SGSM2O43147 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SGSM2O43147 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SGSM2O43147 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SGSM2O43147 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SGSM2O43147 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SGSM2O43147 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SGSM2O43147 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SGSM2O43147 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SGSM2O43147 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SGSM2O43147 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SGSM2O43147 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SGSM2O43147 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SGSM2O43147 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SGSM2O43147 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SGSM2O43147 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SGSM2O43147 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SGSM2O43147 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SGSM2O43147 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SGSM2O43147 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SGSM2O43147 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SGSM2O43147 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SGSM2O43147 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SGSM2O43147 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms