Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTLC1O15269 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTLC1O15269 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms