Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFDN6O15212 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFDN6O15212 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms