Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPEO14579 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPEO14579 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPEO14579 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPEO14579 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPEO14579 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPEO14579 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPEO14579 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPEO14579 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPEO14579 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPEO14579 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPEO14579 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPEO14579 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COPEO14579 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPEO14579 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COPEO14579 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPEO14579 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPEO14579 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPEO14579 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPEO14579 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPEO14579 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPEO14579 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPEO14579 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPEO14579 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COPEO14579 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPEO14579 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPEO14579 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COPEO14579 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPEO14579 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPEO14579 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPEO14579 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPEO14579 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPEO14579 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPEO14579 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPEO14579 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPEO14579 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPEO14579 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPEO14579 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPEO14579 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPEO14579 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COPEO14579 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COPEO14579 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPEO14579 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPEO14579 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPEO14579 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPEO14579 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPEO14579 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPEO14579 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPEO14579 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPEO14579 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPEO14579 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPEO14579 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPEO14579 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPEO14579 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPEO14579 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPEO14579 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPEO14579 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPEO14579 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPEO14579 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPEO14579 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPEO14579 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPEO14579 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPEO14579 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPEO14579 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPEO14579 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPEO14579 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPEO14579 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPEO14579 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPEO14579 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPEO14579 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPEO14579 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPEO14579 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPEO14579 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
COPEO14579 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPEO14579 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPEO14579 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPEO14579 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPEO14579 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPEO14579 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPEO14579 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPEO14579 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPEO14579 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COPEO14579 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPEO14579 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPEO14579 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COPEO14579 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPEO14579 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPEO14579 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COPEO14579 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPEO14579 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPEO14579 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPEO14579 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPEO14579 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPEO14579 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPEO14579 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPEO14579 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPEO14579 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPEO14579 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPEO14579 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPEO14579 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms