Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAFD1O14545 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAFD1O14545 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAFD1O14545 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAFD1O14545 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAFD1O14545 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAFD1O14545 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAFD1O14545 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms