Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDE2AO00408 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE2AO00408 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms