Protein–RNA interactions for Protein: O00339

MATN2, Matrilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN2O00339 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN2O00339 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN2O00339 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN2O00339 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN2O00339 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN2O00339 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN2O00339 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN2O00339 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN2O00339 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN2O00339 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN2O00339 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN2O00339 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN2O00339 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN2O00339 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN2O00339 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN2O00339 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN2O00339 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN2O00339 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN2O00339 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN2O00339 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN2O00339 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN2O00339 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN2O00339 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN2O00339 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN2O00339 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN2O00339 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN2O00339 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN2O00339 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN2O00339 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN2O00339 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN2O00339 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN2O00339 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN2O00339 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN2O00339 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN2O00339 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN2O00339 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN2O00339 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN2O00339 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN2O00339 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN2O00339 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN2O00339 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN2O00339 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN2O00339 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN2O00339 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN2O00339 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN2O00339 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN2O00339 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN2O00339 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MATN2O00339 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MATN2O00339 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN2O00339 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN2O00339 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN2O00339 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN2O00339 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN2O00339 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN2O00339 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN2O00339 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN2O00339 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN2O00339 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN2O00339 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN2O00339 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN2O00339 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN2O00339 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN2O00339 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN2O00339 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN2O00339 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN2O00339 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN2O00339 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN2O00339 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN2O00339 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN2O00339 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN2O00339 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN2O00339 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN2O00339 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN2O00339 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN2O00339 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN2O00339 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN2O00339 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MATN2O00339 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MATN2O00339 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MATN2O00339 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MATN2O00339 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MATN2O00339 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MATN2O00339 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MATN2O00339 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MATN2O00339 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN2O00339 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN2O00339 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN2O00339 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN2O00339 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN2O00339 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN2O00339 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN2O00339 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN2O00339 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN2O00339 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN2O00339 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN2O00339 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN2O00339 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN2O00339 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN2O00339 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms