Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGPSO00116 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGPSO00116 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGPSO00116 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGPSO00116 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGPSO00116 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGPSO00116 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGPSO00116 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGPSO00116 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGPSO00116 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGPSO00116 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGPSO00116 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGPSO00116 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGPSO00116 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGPSO00116 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGPSO00116 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGPSO00116 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGPSO00116 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGPSO00116 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGPSO00116 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGPSO00116 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGPSO00116 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGPSO00116 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGPSO00116 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGPSO00116 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGPSO00116 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGPSO00116 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGPSO00116 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGPSO00116 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGPSO00116 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AGPSO00116 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGPSO00116 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGPSO00116 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGPSO00116 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGPSO00116 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGPSO00116 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGPSO00116 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGPSO00116 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGPSO00116 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGPSO00116 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGPSO00116 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGPSO00116 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGPSO00116 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGPSO00116 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGPSO00116 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGPSO00116 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGPSO00116 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGPSO00116 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGPSO00116 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AGPSO00116 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGPSO00116 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGPSO00116 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGPSO00116 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGPSO00116 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGPSO00116 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGPSO00116 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGPSO00116 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGPSO00116 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGPSO00116 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGPSO00116 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGPSO00116 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGPSO00116 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGPSO00116 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
AGPSO00116 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGPSO00116 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGPSO00116 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGPSO00116 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
AGPSO00116 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGPSO00116 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGPSO00116 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGPSO00116 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGPSO00116 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGPSO00116 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGPSO00116 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGPSO00116 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGPSO00116 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AGPSO00116 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGPSO00116 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGPSO00116 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGPSO00116 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGPSO00116 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGPSO00116 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGPSO00116 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGPSO00116 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGPSO00116 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGPSO00116 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGPSO00116 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGPSO00116 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGPSO00116 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGPSO00116 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AGPSO00116 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGPSO00116 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGPSO00116 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGPSO00116 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGPSO00116 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGPSO00116 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGPSO00116 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGPSO00116 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGPSO00116 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGPSO00116 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms