Protein–RNA interactions for Protein: H7C4K7

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C4K7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H7C4K7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H7C4K7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H7C4K7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
H7C4K7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H7C4K7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H7C4K7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
H7C4K7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H7C4K7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H7C4K7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H7C4K7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H7C4K7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H7C4K7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H7C4K7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H7C4K7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H7C4K7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H7C4K7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H7C4K7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H7C4K7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H7C4K7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H7C4K7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H7C4K7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H7C4K7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H7C4K7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H7C4K7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
H7C4K7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H7C4K7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H7C4K7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H7C4K7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H7C4K7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H7C4K7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H7C4K7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H7C4K7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H7C4K7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H7C4K7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H7C4K7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H7C4K7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H7C4K7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H7C4K7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H7C4K7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H7C4K7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H7C4K7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
H7C4K7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H7C4K7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H7C4K7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
H7C4K7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H7C4K7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H7C4K7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H7C4K7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H7C4K7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H7C4K7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H7C4K7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H7C4K7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
H7C4K7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H7C4K7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
H7C4K7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H7C4K7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H7C4K7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H7C4K7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H7C4K7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
H7C4K7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H7C4K7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H7C4K7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H7C4K7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H7C4K7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H7C4K7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H7C4K7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
H7C4K7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H7C4K7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H7C4K7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H7C4K7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H7C4K7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H7C4K7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H7C4K7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H7C4K7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H7C4K7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H7C4K7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H7C4K7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H7C4K7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H7C4K7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H7C4K7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H7C4K7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H7C4K7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H7C4K7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H7C4K7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H7C4K7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H7C4K7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
H7C4K7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H7C4K7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H7C4K7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H7C4K7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H7C4K7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H7C4K7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
H7C4K7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H7C4K7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H7C4K7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
H7C4K7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
H7C4K7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H7C4K7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H7C4K7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms