Protein–RNA interactions for Protein: F8VRH5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VRH5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F8VRH5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F8VRH5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F8VRH5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
F8VRH5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
F8VRH5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F8VRH5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F8VRH5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F8VRH5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
F8VRH5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F8VRH5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F8VRH5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F8VRH5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
F8VRH5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F8VRH5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F8VRH5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F8VRH5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F8VRH5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F8VRH5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
F8VRH5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F8VRH5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F8VRH5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
F8VRH5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F8VRH5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F8VRH5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F8VRH5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8VRH5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8VRH5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8VRH5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
F8VRH5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8VRH5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8VRH5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
F8VRH5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8VRH5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8VRH5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8VRH5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8VRH5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8VRH5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8VRH5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8VRH5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8VRH5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8VRH5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8VRH5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8VRH5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8VRH5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8VRH5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8VRH5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8VRH5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8VRH5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8VRH5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8VRH5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8VRH5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
F8VRH5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8VRH5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8VRH5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8VRH5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8VRH5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8VRH5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8VRH5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8VRH5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8VRH5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8VRH5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8VRH5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8VRH5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8VRH5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8VRH5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8VRH5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8VRH5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
F8VRH5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8VRH5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8VRH5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8VRH5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8VRH5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8VRH5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8VRH5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8VRH5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8VRH5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8VRH5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8VRH5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8VRH5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8VRH5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8VRH5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8VRH5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8VRH5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8VRH5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8VRH5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8VRH5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8VRH5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8VRH5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8VRH5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8VRH5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8VRH5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
F8VRH5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8VRH5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8VRH5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8VRH5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8VRH5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8VRH5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8VRH5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8VRH5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms