Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms