Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC32

KIF28P, Kinesin-like protein KIF28P, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF28PB7ZC32 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KIF28PB7ZC32 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF28PB7ZC32 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms