Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00587B1AMM8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00587B1AMM8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms