Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VGLL3A8MV65 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VGLL3A8MV65 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms