Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC144AA2RUR9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC144AA2RUR9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC144AA2RUR9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC144AA2RUR9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC144AA2RUR9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC144AA2RUR9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC144AA2RUR9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC144AA2RUR9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC144AA2RUR9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC144AA2RUR9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC144AA2RUR9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC144AA2RUR9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC144AA2RUR9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC144AA2RUR9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC144AA2RUR9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC144AA2RUR9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC144AA2RUR9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC144AA2RUR9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC144AA2RUR9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC144AA2RUR9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC144AA2RUR9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC144AA2RUR9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms