Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0U1RQF3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0U1RQF3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms