Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX2IPQ9Y2D8 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX2IPQ9Y2D8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX2IPQ9Y2D8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX2IPQ9Y2D8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX2IPQ9Y2D8 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX2IPQ9Y2D8 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX2IPQ9Y2D8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX2IPQ9Y2D8 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX2IPQ9Y2D8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX2IPQ9Y2D8 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSX2IPQ9Y2D8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX2IPQ9Y2D8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX2IPQ9Y2D8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX2IPQ9Y2D8 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX2IPQ9Y2D8 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX2IPQ9Y2D8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX2IPQ9Y2D8 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX2IPQ9Y2D8 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX2IPQ9Y2D8 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX2IPQ9Y2D8 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX2IPQ9Y2D8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSX2IPQ9Y2D8 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX2IPQ9Y2D8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms