Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC4Q9Y296 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms