Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms