Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.5 ms