Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNRF3Q9ULT6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms