Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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