Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ZNF346Q9UL40 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ZNF346Q9UL40 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ZNF346Q9UL40 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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