Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms