Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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SNX15Q9NRS6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SNX15Q9NRS6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SNX15Q9NRS6 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SNX15Q9NRS6 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SNX15Q9NRS6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SNX15Q9NRS6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SNX15Q9NRS6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SNX15Q9NRS6 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SNX15Q9NRS6 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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