Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms