Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms