Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms