Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms