Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
IFT27Q9BW83 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms