Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms